Wysoki poziom amonu wskazuje na zakłócone lub niewystarczające oczyszczanie przez bakterie, np. po wymianie wody lub przy nowych zbiornikach. Jeżeli pH jest powyżej 7, większa ilość amonu będzie przekształcona w amoniak, który jest toksyczny dla ryb. Wiąże się to z ryzykiem uszkodzenia skrzeli i udzuszenia ryb. Nawet tak niski poziom amoniaku jak 0,02 mg/l jest niebezpieczny dla ryb.